Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 AC034187.1-201ENST00000437047 561 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
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FOXD1Q16676 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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FOXD1Q16676 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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FOXD1Q16676 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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FOXD1Q16676 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FOXD1Q16676 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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