Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA2Q15822 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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