Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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