Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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