Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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