Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RAB40BQ12829 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RAB40BQ12829 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RAB40BQ12829 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RAB40BQ12829 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RAB40BQ12829 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RAB40BQ12829 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RAB40BQ12829 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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