Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms