Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms