Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms