Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCAMP43121 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCAMP43121 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCAMP43121 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCAMP43121 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCAMP43121 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCAMP43121 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCAMP43121 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms