Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF1P30408 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms