Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2CP19387 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms