Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms