Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB1P08034 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJB1P08034 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJB1P08034 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB1P08034 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB1P08034 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB1P08034 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms