Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EGFRP00533 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EGFRP00533 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EGFRP00533 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EGFRP00533 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGFRP00533 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EGFRP00533 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EGFRP00533 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms