Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM37O94972 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms