Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms