Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRBOX1C9JBD0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms