Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
RAB3CQ96E17 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RAB3CQ96E17 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RAB3CQ96E17 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RAB3CQ96E17 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RAB3CQ96E17 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RAB3CQ96E17 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RAB3CQ96E17 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
RAB3CQ96E17 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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