Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TNXAQ16473 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TNXAQ16473 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TNXAQ16473 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.5 ms