Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SSX1Q16384 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SSX1Q16384 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
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SSX1Q16384 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
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SSX1Q16384 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
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SSX1Q16384 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SSX1Q16384 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SSX1Q16384 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SSX1Q16384 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
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