Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IFT88Q13099 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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