Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRUQ92729 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRUQ92729 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PTPRUQ92729 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms