Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLPPQ16740 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CLPPQ16740 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CLPPQ16740 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.8 ms