Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZIC1Q15915 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZIC1Q15915 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166 ms