Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
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CHD4Q14839 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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CHD4Q14839 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD4Q14839 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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CHD4Q14839 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD4Q14839 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
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