Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1SQ13698 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1SQ13698 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
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