Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMARCB1Q12824 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMARCB1Q12824 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SMARCB1Q12824 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.5 ms