Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP4-12Q9BQ66 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
KRTAP4-12Q9BQ66 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
KRTAP4-12Q9BQ66 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
KRTAP4-12Q9BQ66 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.7 ms