Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECM1Q16610 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ECM1Q16610 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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