Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RIPK1Q13546 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RIPK1Q13546 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.82□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RIPK1Q13546 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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