Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HIF1AQ16665 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HIF1AQ16665 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
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