Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKN1Q16512 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKN1Q16512 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKN1Q16512 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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