Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.4 ms