Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IKZF1Q13422 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IKZF1Q13422 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IKZF1Q13422 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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