Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRNQ16849 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRNQ16849 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.5 ms