Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
USF2Q15853 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
USF2Q15853 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
USF2Q15853 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
USF2Q15853 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
USF2Q15853 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
USF2Q15853 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
USF2Q15853 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
USF2Q15853 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
USF2Q15853 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
USF2Q15853 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
USF2Q15853 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
USF2Q15853 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
USF2Q15853 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
USF2Q15853 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
USF2Q15853 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
USF2Q15853 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
USF2Q15853 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
USF2Q15853 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
USF2Q15853 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
USF2Q15853 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
USF2Q15853 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
USF2Q15853 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
USF2Q15853 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
USF2Q15853 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
USF2Q15853 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
USF2Q15853 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
USF2Q15853 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
USF2Q15853 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
USF2Q15853 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
USF2Q15853 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
USF2Q15853 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
USF2Q15853 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
USF2Q15853 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
USF2Q15853 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
USF2Q15853 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
USF2Q15853 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
USF2Q15853 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
USF2Q15853 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
USF2Q15853 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
USF2Q15853 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
USF2Q15853 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
USF2Q15853 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
USF2Q15853 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
USF2Q15853 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
USF2Q15853 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
USF2Q15853 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
USF2Q15853 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
USF2Q15853 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
USF2Q15853 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
USF2Q15853 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
USF2Q15853 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
USF2Q15853 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
USF2Q15853 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
USF2Q15853 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
USF2Q15853 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
USF2Q15853 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
USF2Q15853 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
USF2Q15853 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
USF2Q15853 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
USF2Q15853 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
USF2Q15853 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
USF2Q15853 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
USF2Q15853 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
USF2Q15853 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
USF2Q15853 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
USF2Q15853 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
USF2Q15853 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
USF2Q15853 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
USF2Q15853 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
USF2Q15853 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
USF2Q15853 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
USF2Q15853 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
USF2Q15853 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
USF2Q15853 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
USF2Q15853 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
USF2Q15853 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
USF2Q15853 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
USF2Q15853 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
USF2Q15853 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
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