Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SYCP1Q15431 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
SYCP1Q15431 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
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