Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
XRCC4Q13426 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
XRCC4Q13426 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
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