Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KCNMA1Q12791 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KCNMA1Q12791 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254.6 ms