Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-2.88□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-2.9□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
CPSF1Q10570 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-2.97□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CPSF1Q10570 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-3.02□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CPSF1Q10570 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
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