Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.3 ms