Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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HERPUD1Q15011 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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HERPUD1Q15011 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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HERPUD1Q15011 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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HERPUD1Q15011 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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