Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLN3Q13286 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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