Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRMP28827 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRMP28827 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRMP28827 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
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PTPRMP28827 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRMP28827 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRMP28827 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRMP28827 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRMP28827 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRMP28827 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRMP28827 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRMP28827 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRMP28827 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRMP28827 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRMP28827 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
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PTPRMP28827 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
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PTPRMP28827 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
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