Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTPRDP23468 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRDP23468 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
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