Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SYNMO15061 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYNMO15061 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYNMO15061 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYNMO15061 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYNMO15061 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYNMO15061 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYNMO15061 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYNMO15061 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYNMO15061 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYNMO15061 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYNMO15061 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYNMO15061 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYNMO15061 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYNMO15061 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYNMO15061 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYNMO15061 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYNMO15061 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SYNMO15061 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SYNMO15061 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SYNMO15061 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SYNMO15061 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SYNMO15061 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SYNMO15061 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SYNMO15061 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SYNMO15061 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SYNMO15061 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SYNMO15061 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SYNMO15061 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SYNMO15061 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SYNMO15061 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SYNMO15061 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SYNMO15061 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SYNMO15061 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-2.46□□□□□ -2.8
SYNMO15061 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SYNMO15061 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYNMO15061 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYNMO15061 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYNMO15061 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYNMO15061 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYNMO15061 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYNMO15061 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYNMO15061 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SYNMO15061 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SYNMO15061 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SYNMO15061 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SYNMO15061 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYNMO15061 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYNMO15061 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYNMO15061 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYNMO15061 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYNMO15061 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYNMO15061 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYNMO15061 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYNMO15061 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYNMO15061 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYNMO15061 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
SYNMO15061 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SYNMO15061 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SYNMO15061 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SYNMO15061 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SYNMO15061 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SYNMO15061 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SYNMO15061 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SYNMO15061 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SYNMO15061 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SYNMO15061 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SYNMO15061 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SYNMO15061 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SYNMO15061 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SYNMO15061 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SYNMO15061 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SYNMO15061 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SYNMO15061 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SYNMO15061 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SYNMO15061 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SYNMO15061 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SYNMO15061 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SYNMO15061 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SYNMO15061 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SYNMO15061 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SYNMO15061 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SYNMO15061 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SYNMO15061 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SYNMO15061 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SYNMO15061 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SYNMO15061 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SYNMO15061 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SYNMO15061 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SYNMO15061 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SYNMO15061 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SYNMO15061 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SYNMO15061 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SYNMO15061 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SYNMO15061 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
SYNMO15061 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SYNMO15061 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
SYNMO15061 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SYNMO15061 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SYNMO15061 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.7 ms