Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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COL19A1Q14993 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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COL19A1Q14993 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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COL19A1Q14993 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL19A1Q14993 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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COL19A1Q14993 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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COL19A1Q14993 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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COL19A1Q14993 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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