Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-3.67□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
LINC00587B1AMM8 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-3.73□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-3.74□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms