Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.64□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-2.7□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-2.7□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-2.72□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SCN11AQ9UI33 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
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