Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP4-12Q9BQ66 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.4 ms